江戸幕府がキリシタン弾圧を行い、信者を改宗させ、近在の寺から寺請証文をとって身分証明をしたことが発端だとされる。その後、寺請証文は日本人全員に義務付けられ、葬式等が創出される。これにより、寺院と檀家の関係が深められ、檀家制度は強固なものとなった。